Wayang muzeum, se nachází v západní části areálu Fatahillah. Wayang muzeum vypráví návštěvníkům o "Wayang" - indonéského stínového divadla, v inscenacích, které používaly loutek "Wayang".

Takové stínové divadlo jsou rozšířené na ostrovech Javy a Bali. Loutky jsou vyrobeny z buvolů, potom se údaj je připojen k bambusové tyče. Figurky Dalang pohybuje za zástěnou, herec-loutkáře. Nejčastěji Dalang je vypravěč, navíc zpívá a někdy dokonce skládá spiknutí.

Muzeum bylo postaveno na místě, kde kdysi stával kostel .  Chrám byl postaven v roce 1640 a byl nazýván Old Dutch církev .  V roce 1732 byla stavba kostela aktualizovány, a chrám stal se známý jako New Dutch Church .  V roce 1808 zemětřesení zničilo církev .  Později, v roce 1912 na troskách kostela postavili novou budovu, v novorenesanční .  Za prvé, v budově sídlí sklad společnosti «Geo Wehry & Co» .  V roce 1938 byla obnovena budova, dávat rysy holandské koloniální styl .  Později byla budova koupil vědeckou komunitou Batavia, která se zabývá otázkami kultury a vědy v Indonésii .  Vědecká obec převedl stavební fond Starého Batavia, a v roce 1939 tam byl muzeum na Starém Batavia .  V roce 1957, poté, co Indonésie získal jeho nezávislost, byla budova předána indonéské kulturního institutu, a potom - na ministerstvu školství a kultury .  Po všem tom byrokracie, v roce 1968 správa hlavního okresu Jakarta se rozhodl zřídit v této budově Muzeum Wayang .  Slavnostní otevření muzea se konalo v roce 1975 . 

Vzhledem k rozsáhlé sbírky muzea, mohou návštěvníci dozvědět více o Wayang loutek a umění, jako je "stínové divadlo". V muzeu můžete vidět wayang kulit, (stínové divadlo), wayang-Golek (divadlo dřevěné panenky). Na displeji jsou vystaveny panenky z jiných zemí, jako je Malajsie, Thajska, Číny, Vietnamu, Indie, Kambodži, Surinam. Po návštěvě muzea mohou návštěvníci dozvědět o gamelan - tradičního indonéského orchestru.

Pravidelně, Muzeum ukazuje představení Wayang loutek, stejně jako mistrovské kurzy pro jejich výrobu.