Podle legendy, jméno "hora Misharin" pochází z určitého úředníka Munekhin Misyura, který žil v první polovině 16. století, který byl známý pro jeho charitativní práci ve vztahu k Bohu kostelů. Autoritativní etnograf Okulich Casarín-NS spíše nejvěrohodnější verze původu názvu chrámu, od malých bažin, nosil jméno mshary, protože to je taková bažiny někdy ve starověku a byl obklopen hory.
Stavba kamenného kostela došlo v roce 1547. Zpočátku, kostel byl klášter. Záznamy Kniha Scribe v roce 1623 uvádí, pánskou klášter s Misharin Kotelnikovo hor. To je to, co je napsáno v klášteře Všeruského Chetyah Mina Metropolitan Macarius. Tam je spekulace, že opat kláštera Nyquist během 60. let 16. století byla Vassili Barlaam, kdo je autor životy Alexandra Něvského, Pskov Evfrosina.
V roce 1808, chrám byl určen k demolici jako velmi starý, ale stále svatý synod nesouhlasila tuto akci. V roce 1882, obchodník od Pskov Stehnovskim Peter Michajlovič předních dveří byl postaven kamenný přístavba. V průběhu let 1892-1896 byly provedeny restaurátorské práce na cash kurátor - Kafelnikov Ivan Michajlovič - čestným občanem města Pskov. Kostel má dva trůny, z nichž hlavní je trůn evangelisty a apoštola Jana bohoslovec, a druhá je volána ve jménu svatého mučedníka Jana bojovník. V letech 1786-1808 byl kostel přidělen vzvoz George chrám, a v roce 1934 byl připočítán s kostelem svatých apoštolů císař Konstantin a jeho matka královna Helena.
Kostela zvonice byla postavena ve stejné době se stavbou chrámu svatého Jana Křtitele. Zvonek visel šest zvony. Ve farnosti byly tři kaple, postavené ze dřeva: St. Nicholas Wonderworker, a poblíž obce Hryastolovo Holy Martyr Anastasia a St Martyr Anastasia.
Kostel Jana Křtitele existovala hospic, farní péče, nemocnice, ale farní škola nebyla nikdy postavena. Na konci 19. století v obci zvané Kozí Brod byl postaven u kostela farní školy, ale brzy v roce 1895 z důvodu blízkosti jiných městských škol, byla uzavřena.
Podél obvodu celého kostela je hřbitov, ve které jsou pohřbeni historik a etnograf Tsvylёv SA, Smirnov obnovu VP a vojáků, kteří zemřeli během bojové povinnosti.
Od roku 1913, chrám sloužil jako kněz Kolobov Fedor. V roce 1927, poté, co byl několikrát zatčen, Fedor byl vyhoštěn na Ural. Kolobov žena za ním, pak se žádné informace o nich byla hlášena. Ministrant, jáhen byl Michail Lebedev, ale jeho pozdější život není nic známo.
23.prosince 1936, bylo rozhodnuto uzavřít do kostela, ale podle jiných zdrojů, služba pokračovala až do druhé světové války. Během války, chrám získal nějakou škodu na stěny, střechy, interiéru a exteriéru. V letech 1970-1989 architekta V. Lebedev Bylo provedení kompletní obnovu kostela. 03.03.1965 kostel hřbitov byla uzavřena k pohřbívání.
První služba začala v roce 1992 s vchodu do chrámu. Oživení kostela svatého Jana Křtitele je úzce spjata se jménem slavného opat Jonáše. Přispět k obnově kostela a ředitele Pskov kabelovny Viktor Kukushkin.
V roce 2001, Pskov arcibiskup Eusebius dělá vysvětil osm zvonů, které byly odlity ve Voroněži na staré cestě. Dnes se v kostele nedělní škole a pouť úřad, který obdržel status diecézní.