Muzeum andských svatyní byla založena v roce 1996, poté, co významný archeologický výzkumný projekt "výška Oltář Sur Andino", v čele s Dr. Johan Reinhard a Jose Antonio Chavez. Muzeum se nachází zmrazené "Mumie Juanita" a další objekty kultury Inků.

Studie prováděné na Katolické univerzitě v Santa Maria čtyři desetiletí v regionu Arequipa, bylo zjištěno mnoho archeologických artefaktů, které jsou nyní na displeji v sedmi sálech muzea. Světoznámá mumie "Juanita, dívka v ledu" s její věno - jeden z nejznámějších exponátů muzea, který může být viděn od 1. května do 31. prosince každého roku. Zbývající čtyři měsíce Juanita je v úplné tmě, pro lepší ochranu zmrzlého tělesa dívky (její tělo nebyl podroben procesu mumifikace). Juanita, také známý jako Lady Ampat, byl nalezen v roce 1995 na svazích sopky ve výšce Ampat 5800 metrů nad mořem. Juanita radiocarbon studie ukázaly, že jí bylo 530 let, přesnější času pohřbení - 1466 nl.

Návštěvníci mohou také vidět exponáty ze dřeva, kovu, textilu, zlata a keramiky, které byly použity při obřadech v Inca Capac Cocha, Viracocha, stejně jako zlato a keramických figurek, dobře zachovalých přikrývek.

V současné době je výzkumné centrum UCSM na Katolické univerzitě v Santa Maria de Arequipa má 6 speciálních mrazničky s teplotou 26 ° C pod nulou, stejně jako dvě speciální výstavní stánek s udržováním tohoto teplotu a počítačové řízení provozovatele. Také v muzeu je instalována klimatizační systém pro zachování archeologických materiálů.