Nagasaki se objevil na konci XVI století jako malý přístav vesnice, pak se stal městem, že v příštích dvou a půl století byl jediný přístav otevřené pro mezinárodní obchod. Do konce století XVII Nagasaki se stal jedním z největších japonských misijních center, a teď to je doma k největší křesťanské komunity v zemi.

Tyto a další fakta z historie města je možné najít na muzeum historie a kultury Nagasaki. To bylo otevřeno v roce 2005 v bývalé sídlo kontroly Nagasaki. Tato stavba patří k stavbám období středověku, prošla kompletní rekonstrukcí. Během druhé světové války, byla tato stavba ředitelství protivzdušné obrany Nagasaki. V protiletecký kryt, který se nachází v západní části budovy v době atomové bombardování obyvatel města hledal útočiště.

Muzejní sbírky zahrnuje 48.000 položek, včetně dokumentů, uměleckých děl a řemesel, stejně jako položky, přinesl do Japonska zahraničních obchodníků. Expozice muzea z velké části věnován tématu mezinárodních vztahů a kontaktů s jinými zeměmi Japonsku během jeho izolace, pokrývající XVII století XIX. Zejména Stálá expozice představuje exponáty přinesl z Holandska, Číny a Koreje. V muzeu si můžete také získat představu o takzvané kultury nebo kultury Nanban "jižní barbaři" - přistěhovalci z Portugalska a Španělska. Součástí sbírky muzea je věnována na zavedení a šíření křesťanství.

Prostor muzea je rozdělena do tří částí, z nichž jedna je přiřazena k objektu a obsahuje rekonstrukci Nagasaki Magistrát životě úředníků středověku. Další dvě části jsou věnovány historické kultury a moderního života Nagasaki - na místě města v hospodářství a veřejné sféře v zemi je vůdce.